Plano de Gestão de Dados : uma introdução

Um plano de gestão de dados (PGD ou Data Management Plan) é um documento que descreve como os dados serão obtidos, documentados, organisados, amarzenados securisados, preservados e compartilhados durante a fase de pesquisa e depois do fim do projeto. O objetivo é facilitar a compreensão e a reutilização futura dos dados. De maneira prática ajuda a identificar os riscos ligados na gestão de dados, identificar as ações a fazer e as responsabilidades, além de planificar os recursos e competências necessárias para tal gestão.

O PGD é na maiora dos casos ligado a um projeto de pesquisa e concerne todas as fases do ciclo de vida dos dados e todos os conjuntos de dados do projeto. Ele é criado no início do projeto e depois atualizado durante o projeto.

Esses planos são desenvolvidos pelas universidades, agências de fomento à pesquisa ou centros nacionais de dados que visam, cada vez mais, a abertura dos dados de pesquisas, de modo que, para se obter um financiamento, são exigidos os planos de gestão dos dados com suas metas e os planos das instituições de pesquisa.

Nos Estados Unidos, o OSTP (Office of Science and Technology Policy)  publicou um plano de acesso público em 2013 e muito agências americanas estão exigindo um PGD [8]. A União Européia também tem um open data pilot [9] onde todos os projetos desde o início de 2017 devem compartilhar dados que podem ser compartilhados [10] e submeter seus planos de gestão de dados. O Reino Unido (Cancer Research UK,  Research Councils UK,  Welcome Trust, a Holanda ( Netherlands Organisation for Scientific Research), a Austrália (Australian Research Council, National Health and Medical Research Council, o Canada – Genome Canada) e enfim na Finlândia (Academy of Finland).

 

Os PGDs incluem, de modo geral, os seguintes itens [1]:

  • Descrição do projeto;
  • Autores e afiliações;
  • Exigências das agências de fomento ou de uma instituição;
  • Tipo de dados produzidos;
  • Normas de metadados* e dados;
  • Regras para distribuição e reutilização;
  • Planos para conservação e arquivamento.

Essas informações são resumidas na figura seguinte :

Infografia de PGD. Fonte Data management for students: Data management http://libguides.ru.nl/datamanagementEN/dm Based on a University Library Nijmegen publication on http://ru.nl.libguides.com.

Existem variações entre conteúdo e orientação dos PGDs. Por exemplo, o Digital Curation Center Checklist for a data management plan [2] ** tem foco nas exigências de agência de fomento. Outros modelos exigem mais detalhes sobre a coleta de dados, o volume e o formato ou a preservação. O PGD aborda as questões éticas e aconselha que se mencione uma pessoa/instituição responsável pela gestão dos dados.

Ferramentas para redação de PGDs

Existem duas ferramentas para ajudar na criação do plano de gestão de dados O DMP Tool,  criado pela University of California’s California Digital Library (CDL)  e o DMP Online, criado pelo DCC (Digital Curation Center) . Cada um permite aos usuários

  • criar um PGD em função das exigências dos financiadores ou de uma instituição. usando as ajudas e os exemplos online.
  • Compartilhar um PGD com outros usuários seguido de possibilidade de leitura ou de escritura.
  • Exportar um PGD em diferentes formatos incluindo microsoft Word e PDF.

Diferentes instituições usaram esses software para implementar as próprias plataformas : a França com Opidor, a Finlandia com Tuuli etc.

Diferentes padrões de PGD podem ser implementados seguindo as instruções de um órgão de pesquisa ou de uma agência de fomento. O padrão da União Européia tem uma seção para detalhar os princípios FAIR. Uma ajuda em contexto é disponível e pode ser implementada.

Existem ferramentas com versões em inglês , françês  e outra língua, mas penso que não tem em português. As instituições usando DMP Online tem funcionalidades de administração para implementar qualquer padrão de PGD ou de texto de ajuda.

Enfim, são várias as ferramentas e os desenvolvimentos sobre essas ferramentas. DMP Online e DMP Tools estão desenvolvendo uma ferramenta comum e único o ROADMAP [11] e há também uma iniciativa de Active Management Plan , onde irão interagir com outras ferramentas como repositórios de dados para compartilhar informações [12]

Exemplos de Plano de gestão de dados

Fontes 

[1] Aventurier, P., Alencar, M. d. C. F. (2016). Os desafios de dados de pesquisa abertos. RECIIS, 10 (3). http://prodinra.inra.fr/record/372582

[2] Digital Curation Checklist. Checklist for a Data Management Plan. http://www.dcc.ac.uk/resources/data-management-plans/checklist

[3] QUT Library. Data Management Plan FAQs https://dmp.qut.edu.au/about_us

[4] MIT. Write a data management plan. https://libraries.mit.edu/data-management/plan/write/

[5]ICPSR. Guidelines for Effective Data Management Plans http://www.icpsr.umich.edu/icpsrweb/content/datamanagement/dmp/index.html

[6] Radbout University Library. Data management for students: Data management http://libguides.ru.nl/datamanagementEN/dm

[7] EUDAT & OpenAIRE Webinar: How to write a Data Management Plan – July 14, 2016 https://www.slideshare.net/EUDAT/eudat-openaire-webinar-how-to-write-a-data-management-plan-july-14-2016

[8]  NC State University Library. Funding Agency Guidelines https://www.lib.ncsu.edu/guides/datamanagement/funding_agencies

[9] OpenAire. What is the Open Research Data Pilot?Updated on 15 November 2016 https://www.openaire.eu/opendatapilot

[10] European Commission (2017). EC’s Guide on Open Access Scientific Publications and Research Data.  March 21, 2017. http://ec.europa.eu/research/participants/data/ref/h2020/grants_manual/hi/oa_pilot/h2020-hi-oa-pilot-guide_en.pdf

[11] DMP Roadmap Github : https://github.com/dmproadmap

[12] Research Data Alliance (2017). Overview slides – RDA9 Active DMP IG session. https://www.rd-alliance.org/overview-slides-rda9-active-dmp-ig-session

Ver também o site do SIBIUSP sobre Plano de Gestão de Dados https://www.sibi.usp.br/apoio-pesquisador/dados-pesquisa/plano-gestao-dados-2/

  • *os metadados são um onjunto de dados estruturados que identificam os dados de um determinado documento e que podem fornecer informação sobre o modo de descrição, administração, requisitos legais de utilização, funcionalidade técnica, uso e preservação. (TAYLOR, 1999 e DEMPSEY, 1998) citado no curso Metadados : dados a respeito de dados. de  (2006).  https://pt.slideshare.net/gemireki/metadados-dados-a-respeito-de-dados-presentation-596079
  • **Curadoria digital é a seleção preservação, manutenção, coleção e arquivamento de ativos ou dados digitais.  Curadoria digital é geralmente relacionada ao processo de criação e desenvolvimento de repositório de dados para consultas atuais e futuras realizadas por pesquisadores, cientistas, historiadores e estudiosos.  (wikipedia)

Unpaywall, uma extenção Chrome para achar a versão dos artigos em acesso aberto

 

Ferramentas que exploram a infra-estrutura de acesso aberto e melhoram o esforço para o  livre acesso  das revistas científicas, repositórios abertos e bibliotecas estão aparecendo. Assim Unpaywall é uma nova extensão disponível para o navegador Chrome (não fiz o teste com Firefox) que lhe permite encontrar versões disponíveis gratuitamente, em acesso aberto dos artigos que você está visualizando . Unpaywall é desenvolvido pelo Impactstory, e usa o API ( Interface de Programação de Aplicativos) oadoi  para achar a versão em livre acesso dos artigos legalmente depositados.  As fontes usadas são : o DOAJ ( repertório  dos jornais em acesso livre), Crossref (serviço de troca de metadados dos artigos dos principais editores ), DataCite (gestão de identificadores), et BASE ( principal “harvester” dos repositórios abertos). (ver o post de AIMS-FAO).

Em consulta, no navegador Chrome, uma luz verde aparece (se não existe uma versão de acesso aberto, é cinza):

Ao clicar no sinal verde, a versão de acesso aberto é exibida:

Fontes :

Cite this article as: Pascal Aventurier, "Unpaywall, uma extenção Chrome para achar a versão dos artigos em acesso aberto," in A publicação científica, 02/05/2017, https://publicient.hypotheses.org/1715.

Onde achar dados de pesquisa em agronomia, alimentos e meio-ambiente ?

https://www.ars.usda.gov/oc/images/photos/oct07/d890-1/ Photo by Peggy Greb.
https://www.ars.usda.gov/oc/images/photos/oct07/d890-1/ Photo by Peggy Greb.

O movimento do compartilhamento dos dados de pesquisa é uma realidade. Mais como acessar essas informações  ? Atualmente apesar da ferramenta Datasearch do Elsevier em beta versão, não existe ferramenta única para buscar dados de pesquisa. A lista de sites seguintes dá algumas dicas para achar os conjuntos de dados. Esta lista pode evoluir em função das suas sugestões (por email) ou de atualizações. Há repositórios de dados genéricos : a lista está disponível no Onde achar dados de pesquisa em saúde ? O site Re3data.org é uma catálogo internacional de repositórios de dados e a melhor fonte atualmente para achar repositórios.

Continuar a ler “Onde achar dados de pesquisa em agronomia, alimentos e meio-ambiente ?”

Princípios FAIR : critérios de qualidade para dados de pesquisa

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fonte : Imagen da Uniprot autor Sangra Pundir CC-BY-SA-4.0 (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:FAIR_data_principles.jpg)

A qualidade dos conjuntos de dados de pesquisa é muito importante e precisa definir os critérios para avaliar a qualidade dos conjuntos de dados. Uma boa gestão de dados é também essencial para facilitar descobertas, inovação e reutilização para uma comunidade, depois o processo de publicação [9] . Continuar a ler “Princípios FAIR : critérios de qualidade para dados de pesquisa”

Onde achar dados de pesquisa em saúde ?

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By Adrienne Yancey for opensource.com https://opensource.com/health/11/5/open-health-and-medical-gag-orders

O movimento do compartilhamento dos dados de pesquisa é uma realidade. Mais como acessar essas informações  ? Atualmente apesar da ferramenta Datasearch do Elsevier em beta versão, não tem ferramenta única para buscar dados de pesquisa. A lista de sites seguinte dá algumas dicas para achar os conjuntos de dados. Esta lista pode evoluir em função das suas sugestões (por email) ou de atualizações.

Generalidade

Repositórios de dados http://oad.simmons.edu/oadwiki/Data_repositories (seção 12 Medicina) essa página lista vários repositórios de dados em saúde.

re3data.org www.re3data.org/ Re3data.org identifica mais de 1,500 repósitorios de dados. Busca por temática, por exemplo Basic Medical Research (260 repositórios) ou Medicine (358 repositórios).

Há repositórios de dados genéricos como Zenodo, Figshare Dryad 4Tu Centrum,  ou plataformas nacionais : UK Data Archive (UKDA) ou DANS (Holanda) onde é possível  buscar por palavras-chaves e temáticas (ver também o post sobre repositórios genéricos).

O Elsevier lançou o Datasearch em versão beta para procurar conjuntos de dados.  Esta ferramenta busca dentro dos repositórios de dados e os “suplementary materials” dos artigos da plataforma Sciencedirect de Elsevier. Essa ferramenta que pode ser muito util para buscar dados é uma iniciativa de uma empresa privada e faz a promoção dos conteúdos de Science Direct. Ele não faz parte diretamente do movimento de dados abertos, bem como o Data Citation Index de Thomson Reuters que é uma ferramenta disponível na subscrição.

O site Openaire busca dentro dos repositórios os dados dos projetos da União Europeia (programa H2020).

Os repositórios de documentos em acesso livre as vezes contém conjuntos de dados.  Ver lista dos repositórios brasileiros de acesso aberto do IBICT.

Biocaddie data discovery index (DDI) (National Institutes of Health). Biocaddie é um protótipo para de descoberta de dados. A ferramenta Datamed  fornece acesso a conjuntos de dados a partir de 43 repositórios de dados científicos.

Biotecnologia
Ensaios Clínicos
Saúde pública
Genômica
  • EMBL Nucleotide Sequence Database European Nucleotide Archive
  • dbSNP The Nucleotide database – em colaboração com o  National Human Genome Research Institute, o National Center for Biotechnology Information (US) disponibiliza o “The Nucleotide database” que é uma coleção de sequências de várias fontes, incluindo GenBank, RefSeq, TPA and PDB. Genoma, gene e dados da sequência de transcrição.
Bactéria e virus

 

Para ler :

  1. Reis, Juliana e Fernanda Marques, Fernanda (2016) Ensaios clínicos, eis a questão: dados abertos ou não? http://www.periodicos.fiocruz.br/pt-br/content/ensaios-cl%C3%ADnicos-eis-questão-dados-abertos-ou-não
  2.  Centro Latino-Americano e do Caribe de Informação em Ciências da Saúde (Bireme/Opas/OMS) .  Sobre o compartilhamento de dados de ensaios clínicos. 8/03/2016. http://periodicos.fiocruz.br/sites/default/files/anexos/Nota%20Bireme%20-%20compartilhamento-dados-ensaios-clinicos.pdf

Os desafios de dados de pesquisa abertos [artigo]

Aventurier, P. ; de Alencar, MC ( 2016). Os desafios de dados de pesquisa abertos. Revista Eletrônica de Comunicação, Informação & Inovação em Saúde; v. 10, n. 3.  http://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/1069 ou no repositorio do INRA http://prodinra.inra.fr/record/372582.

  • Pascal Aventurier; Institut National de la Recherche Scientifique. Centre de Recherche PACA. Avignon, France.
  • Maria Cleofas de Alencar; Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária. Embrapa Meio Ambiente. Jaguariúna, SP, Brasil.
Resumo

A gestão, a disponibilização e a preservação dos dados de pesquisas são preocupações cada vez mais centrais para os pesquisadores, as instituições de pesquisas e também para as agências de fomento e revistas cientificas. Todos esses têm o objetivo de desenvolver boas práticas de pesquisa que permitam a verificação e a reutilização dos dados, a valorização dos trabalhos de construção de conjuntos de dados e o desenvolvimento de novas maneiras de pesquisar utilizando dados já produzidos. Este artigo apresenta as diferentes etapas do ciclo de vida dos dados e mostra as iniciativas internacionais e nacionais tomadas para desenvolver esse campo que tem grande interesse para a área da saúde.

Abstract
Increasingly, the management, availability and preservation of research data concern researchers, research institutions as well as research funding agencies and scientific journals. All of them aim to develop good research practices allowing the data confirmation and their reuse, the improvement of the dataset building and the development of new ways of searching through the use of data already produced. This paper presents the different stages of the data life cycle and shows the international and national initiatives to develop these important issues to the health field.

Dados de pesquisa : descrição do ciclo de vida de gestão de dados

Os Dados bem organizados e com documentação, com garantia para preservação e enfim compartilhados são essenciais para  a investigação científica e para reforçar as oportunidades de aprender e de inovar.

Os dados de pesquisa tem uma vida alem do projeto que os criam. Pesquisadores devem continuar a trabalhar nos dados depois que os financiamentos acabam, e seguir projetos para que os dados possam ser analisados, citados, atualizados ou qualquer forma de reutilização para outros pesquisadores. Desta forma, a reutilização de dados para criar novas pesquisas alimenta um ciclo de vida.

O ciclo de vida dos dados de pesquisa tem varias representações e envolvem as principais etapas seguintes (ver a figura 1) :

Continuar a ler “Dados de pesquisa : descrição do ciclo de vida de gestão de dados”

Identificadores de autores e de pesquisadores : OrcID, ResearcherId, ISNI, ….

Um identificador de autor ou de pesquisador é um código digital que permite de identificar de maneira única este pesquisador ou autor dentro de um ambiente digital definido (Web Of Science Scopus, CV Lattes, repositórios digitais etc). Ele permite de atribuir a este pesquisador as produções das quais ele é o autor (publicação, dados científicos etc) evitando as confusões relacionadas a homônimo e associando as diferentes formas de escrever o nome de um autor como o nome com iniciais, mudança de nome do autor. Ele evita aos pesquisadores de escrever as informações sobre ele e permite de exportar ou importar as referências de um banco de dados pelo outro se elas são interconectadas. O identificador representa uma chave única que facilita a pesquisa de informação..

O Orcid (Open Researcher and Contributor ID) parece ser uma boa escolha para as razãos seguintes :  Continuar a ler “Identificadores de autores e de pesquisadores : OrcID, ResearcherId, ISNI, ….”