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PeerJ : novo modelo para jornais em acesso livre

peerjlogo

 

PeerJ e um jornal cientifico com um processo de avaliacao pelos pares, em ciências  medicinais  e biológicas  criado por um editor do Plos One e uma outra pessoa  do  Mendeley (1). O PeerJ recebeu apoio do fundo de  O’Reilly Alpha­TechVentures em San Francisco.

Esse jornal esta em acesso livre e segue o modelo “via ouro” (gold road) : os artigos estão disponiveis  em acesso livre para os leitores  mais os autores pagam. Só que na maioria dos casos eles pagam entre $1000 e $3000   para a difusão de cada artigo. Por exemplo, o preço para publicar na revista Plos One é de $1 350.

No PeerJ cada usuário paga  só uma vez $ 299 por um numero ilimitado de submissões  e de artigos aceitos, ou $199 ou $99 para um numero de submissões limitado por ano. Esses preços são majorados de $50 (ver a pagina pricing) se os autores pagam depois que o primeiro artigo e aceito. Todos os autores do artigo devem ser registrado e pagam dentro do limite de 12 autores (se tem mais autores, eles não precisam ser registrados).

Cada autor deve também fazer uma revisão de artigo pelo menos uma vez por ano, se não o Peerj pode decidir que ele deve pagar  $99 para a reativação do membership.  Revisão pode ser  também um comentário informal no PeerJPreprint ou sobre um artigo já aceito (ver a FAQ em inglês).

O sistema de avaliação dos artigos e avaliação por pares (peer review).  E possivel conhecer os  editores acadêmicos  (que tem a funcão de editor para uma especialidade) através  dos perfis, o PeerJ funcionando também como uma rede social,  criando uma comunidade.

Todos os artigos são em acesso livre, para leitura e reutilisação. Os autores guardam o copyright a “CC-BY 3.0” license. Os artigos são arquivados com sistemas clássicos  :   PubMedCentral and CLOCKSS).

Tem também possibilidade de submeter um preprint in PeerJ Preprints. Uma funcionalidade  interessante e que o preprint pode ser publico ou privado,compartilhado só com algumas pessoas. Os cientistas em biologia tradicionalmente não usam muito os preprint.

Uma vez que o artigo e aceito, tem possibilidade de adicionar conteúdo como comentários da avaliação.

Desde a data de lançamento do PeerJ , dia 12 de fevereiro, há 51 artigos publicados. Cada artigo tem dados sobre numero de visitantes e  numero de visitas,  alem dos dados de divulgação nas redes sociais : Facebook, Linkedin, Twitter (ver figura).

peerjarticle36-1

peerj-article36

Neste momento o Peerj não tem fator de impacto porque ele não esta indexado no Web of Science e não tem mais de 3 anos de existência para ser candidato no fator de impacto do JCR. Mais ele é indexado no Google Scholar e Pubmed. Vamos seguir esse jornal no futuro. Ele já fez uma divulgação importante através de vários  artigos de apresentação em jornais [2-3].

1 http://en.wikipedia.org/wiki/PeerJ
2 Journal offers flat fee for ‘all you can publish. Nature. 12 june 2012.  http://www.nature.com/news/journal-offers-flat-fee-for-all-you-can-publish-1.10811
3 PeerJ leads a high-quality, low-cost new breed of open-access publisher. http://www.guardian.co.uk/science/blog/2013/feb/12/peerj-open-access-academic-publisher

Dados de pesquisa ligados a publicações: Uma comparação de 4 principais ferramentas

Os Dados illusblogdatareposioriesde pesquisa são os dados produzidos como objetivo de pesquisa cientifica :  significa dados como fatos, observações , imagens, programas de computador, gravações,  ou experiências para o  argumento, teoria ou teste de hipóteses. Esses dados podem ser brutos, limpos ou ja com tratamento processado,  pode ser realizado em qualquer formato ou mídia [1].

Dados abertos de pesquisas  fazem parte do movimento para o  acesso livre. Ver a declaração do Berlim : Berlin Declaration on Open Access (2003).

As universidades e os orgãos institucionais estão divulgando regras para a conservação digital e a divulgação dos dados (em acesso livre ou não) [2]. O Projeto DataCite ajuda na identificação de 484 repositorios de dados de pesquisa atraves da lista de repositórios de dados [3]. Ver também Databib ou lista da universidade de Oregon [4] . Esses dados estão ligados a publicações cientificas que vão usa-los para os fins de demonstração de novos resultados.

Os editores  também estão adotando políticas para que os dados de pesquisa que são usadas em publicações estejam disponíveis. Ver o  Joint Data Archiving Policy (JDAP) [5].
Escolhi 4 projetos internacionais  (Dryad, Figshare, Pangea, ICPSR)  para divulgar os dados de pesquisa.  Os dados são de 2013.

Nome Tipo de projeto Temáticas Número de depósitos Relações com editores
Dryad nonprofit organization Biociências 2521 data packages , 6888 data files dados são associados com artigos de 182 journais.por exemplo :
Figshare private (Digital Sciences) com parceirias com universidades Todas nd __
Pangea universitario/ união européia observação da Terra, dos oceanos é do atmosfere Dados de mais de 100 projetos arquivos do jornal Earth System Science Data (ESSD)
ICPSR Inter-universidade Ciencias socias nd nd

 

nd : não determinado

Nome Formato de dados Metadados Licença
Dryad

Planilha eletrônica, ficheros planos, imagens, mapas…

Pricing (1st September 2013)

doi, titulo, jornal ,numero, volume, ano autores

, contato, résumo palavra-chave, nome taxonômico, localização geographica, geologia infomarção,titulo e descrição de dados, embargo

Creative Commons Zero (CC0)
Figshare todos tipos : imagens (figure) Planilha eletrônica, dataset, midia, fileset, artigo, poster, presentação Titulo

Autores

Categoria

Tags

Descrição
DOI em previsão

Creative commons
Pangea todos tipos. Os arquivos são convertidas automaticamente AutoresTitulo

Descrição

palavra-chaves

Licença (diferentes CC)
identificação de projeto, instituição etc…

Artigo ligado : identificação com o DOI ou a citação completa

Creative commons
ICPSR formatos formulario Specifico em  Accesso livre

 

[*] Dryad tem varias editores participantes

Accesso o documento no Google Docs 

[1] The University of Melbourne draft policy on the Management of Research Data
OECD Principles and Guidelines for Access to Research Data from Public Funding.

[2] Ten recommendations for libraries to get started with research data management. Liber Group. 2012

[3] Datacite.org

[4] Databib ou lista da universidade do Oregon

[5] Joint Data Archiving Policy (JDAP)

Avaliação por pares sem editores (1) : Peerageofscience.org

O sistema de avaliação por  pares peer-review esta sendo organizado por cada jornal cientifico. O editor chefe de cada jornal esta organizando a avaliação dos artigos científicos submetidos e aceitos por eles ou não para revisão. Se é o caso ele vai mandar os textos anonimamente por avaliadores  que são outros cientistas e usar os comentários e correções  deles, que seguem critérios rigorosos para recusar,  mandar para os autores corrigirem o texto  se  necessário, ou aceitar a publicação.

Novos serviços envolvem universidades, revistas e sociedade cientificas estão  surgindo,eles oferecem novos serviços para a avaliação pelos pares e submição dos manuscritos , uma comunidade de cientistas para avaliar os manuscritos.

Peerageof science  é um projeto de 3 pesquisadores finlandeses, com  apoio da University of Jyväskylä e University of Eastern Finland. O site foi premiado pelo of ALPSP Award for Publishing Innovation 2012.
Mais de 1000 pesquisadores de 300 instituições e 45 paises são avaliadores do site,
20 jornais estão participando, na área da biológica, 57 manuscritos já foram avaliados desde 22 novembro de 2011, e recebem 2,3 revisãos em media.  Quando o artigo e submetido em função das palavras chaves dos autores; os avaliadores são informados. Há anotações dos avaliadores sobre a qualidade dos textos submetidos (PEQ) e o  artigo final (PAQ). Editores dos jornais parceiros do site podem fazer ofertas de publicaçoes aos autores.  E difícil de saber como  o modelo econômico vai evoluir, mais ele poderá envolver avaliadores que podem receber dinheiro. Jornais que até agora não pagaram nada poderão participar no futuro.

Um artigo publicado numa jornal
Um artigo publicado no jornal ” Evolutionary Ecology”

 

 

As vantagens são para os editores e autores :
Os editores como Carsten Rahbek, editor-in-chief of Ecography  (Wiley), tem o mesmo problema dos editores do jornal journal editors.  Com a explozão dos numeros de artigos submetidos eles tem o problema maior de achar pesquisadores para avaliação dos artigos e a qualidade esta diminuindo. Ele escolheu o Peerageofscience para avaliação. [1]
Os autores submetem os artigos deles uma vez so, depois as correções sobre o artigos são feitas dentro do site. Eles também não precisam escolher o jornal de publicação antes da submissão do artigo.

Com esta funcionando [1] ?

Um pesquisador pode upload um manuscrito, palavra-chave,  e um comentário explicando porque os pares devem  rever ele no Peerage of Science. O manuscrito esta anonimo e só os pesquisadores que tem inscrição no site pode ver ele. Um e-mail  esta sendo de maneira anonima nos  revisores potenciais sem as palavra-chaves do manuscrito concorda com as áreas de expertise deles. Após a revisão do artigo pares podem dar uma nota de 1 a 5 sobre a qualidade da revisão dos outros. Depois os editores da revista podem fazer oferta de publicação aos autores

Cientistas (pesquisadores) recebem um credito para cada revisão de artigo. Submeter um manuscrito no site custa 2 creditos. Assim se os autores querem a revisão  dos textos deles devem fazer revisão antes.

Se o revisor da publicação concorda a revisão pode ser publicada no journal Proceedings of Peerage of Science. Assim o cientista pode aumentar  a reputação. O site e de graça atualmente. No futuro  os jornais deverão pagar para acessar no site mais o custo devera estar mais barato do que o custo dos editores científicospara fazer a coordenação do sistema de revisão.

Esse serviço funciona por enquanto em Ecologia mais podem ser expandido em outras áreas.

Este tipo de site e muito interessante mais alguns problemas na minha opinião não são resolvidos.
Como os autores poderem dizer que  não querem tal pesquisador para avaliação ?
Como formatar o texto no padrão do jornal final ? Cada um tem um formato diferente (discussão, referencias bibliográficas, …)

Comentários bem-vindos

[1] Online Social Network Seeks to Overhaul Peer Review in Scientific Publishing http://news.sciencemag.org/scienceinsider/2012/01/online-social-network-seeks-to.html

Ver também A New Way for Journals To Peer Review Papers? http://www.sciencemag.org/content/335/6067/385.1.full

Mendeley : inserir refêrencias num documento com o estilo certo

Para inserir refêrencias num documento,  tem um vídeo sobre o blog  Metodologia Científica e Tecnologia.  Mendeley – parte 2 – inserindo referências.

[youtube=https://youtu.be/PdTNC6ALfvo]

Ver também :

Usar outros estilos

Se o estilo que você deve usar não esta no Mendeley no menu view>Citation Styles > more styles. E possível usar o butão get more style (ver em baixo com o style ABNT).

O Mendeley pode usar todos os estilos de apresentação de refêrencias  escritos em CSL (Citation Style Language). Ver como no Mendeley parte 8 – outros estilos CSL

Usar a norma ABNT

As Normas da ABNT Citações e Referências Bibliográficas são muito usados no Brasil.

Os Estilos estão disponiveis no Mendeley Desktop (no seu computador)

estilo na norma ABNT
Mendeley – instalar o estilo ABNT

3º Seminário de avaliação do desempenho dos periódicos brasileiros no JCR 2011

Revistas científicas brasileiras ainda tem baixo impacto internacional | Agência FAPESP :: Especiais. autor  Elton Alisson, 16/10/2012

Agência FAPESP – O número de revistas científicas brasileiras presentes em índices internacionais, como o Journal Citation Report, vem aumentando nos últimos anos. Entretanto, o fator de impacto – o número médio de citações dos artigos científicos publicados em um periódico – ainda é baixo e não atingiu a média mundial.
A constatação foi feita por participantes do 3º Seminário de Avaliação do Desempenho dos Periódicos Brasileiros no JCR 2011, realizado no dia 27 de setembro no Auditório da FAPESP.
Promovido pelo programa Scientific Eletronic Library Online (SciELO Brasil) – resultado de um projeto financiado pela FAPESP –, o objetivo do evento foi debater avanços e desafios para o desenvolvimento da qualidade dos periódicos brasileiros e para o aumento do impacto internacional, com base no Journal Citation Reports (JCR).

Publicada em julho, a última edição do JCR, atualizada com dados de 2011, mostra avanços significativos, mas revela também a persistência de condições e barreiras que dificultam o aumento do impacto dos periódicos nacionais.

Segundo o artigo, no fim de julho, vai acontecer a integração da base do SciELO à Web of Knowledge, a mais abrangente base internacional de informações científicas.

O artigo destaca a importançia dos periodicos brasileiros que permite a difusão e a avaliação da produção científica, que não recebe espaço nos periódicos internacionais. E importante lembrar que a difusão da ciencia se faz por meio de artigos cientificos submetidos pelos periodicos e avaliados pelos outros pesquisadores.
Os periodicos brasileiros precisam  de políticas e ações para aumentar  o impacto internacional deles.

As apresentações estão no site do evento – http://eventos.scielo.org/jcr2011/  na seção http://eventos.scielo.org/jcr2011/programacao/  (>> Download).

Sue Silver, Editor in Chief of Frontiers in Ecology and the Environment apresentou o que os autores querem de uma revista ,
aumentar o trafico sobre o site da revista na internet com conteudo interessante. entre eles

  • uma boa visibililidade e um bom fator de impacto da revista
  • uma boa qualidade do site com diferentes formatos (e-pub),  blog para completar a revista, ligações com  as redes sociais
  • material, o webinar sobre como estar publicado (curso ou meeting)
  • links sobre serviço de ajuda para o inglês.
  • cursos e links sobre a redação cientifica

Segundo Abel L. Packer, Coordenador do Programa SciELO / FAPESP, tem 111 periodicos indexados no JCR ( com fator de impacto) em 2011 (113 em 2010 e 70-80 em 2009) e 137 periodicos indexados no Web of Science. Tambem mostrou que tem outros indicadores como Scimago onde os periodicos brasileiros estao presentes. Os periodicos da Scielo contem 50 % dos  seus artigos em inglês em 2011e a media do FI para as revistas e de 0,533. Scielo Brazil e o primeiro no ranking de portais de acesso aberto do Webometrics.  As interfaces para o tablets e smartphones estão previstas para 2013.

Rogerio Meneghini, Coordenador Científico da SciELO mostrou que a metade dos periodicos brasileiros são gerados para  a sociedade e a outra metade são institucionais. Eles são poucos profissionalisados e depende das agência de fomento.

Luís Reynaldo Ferracciú Alleoni, Editor da Scientia Agricola mostrou que em Ciências Agrárias, a maioria das publicações estão em português é que o fator de impacto das revistas brasileiras não aumentou e depende das autocitações (30% do total das citações ) – Uma autocitação e uma citação que é feita de um artigo da mesma revista que o artigo citado. As solucões são publicar em inglês, e envolver  mais pesquisadores do exterior no processo de avaliação dos artigos.

Observações  a título pessoal

As dicas para aumentar a visibilidade das revistas brasileiras são efetivamente aumentar as parcerias internacionais entre pesquisadores. O programa Ciencia sem Fronteiras  ou Access4.eu:brazil devem ajudar muito as parcerias.

Também tem a barreira da lingua como no caso dos pesquisadores françeses. Apoio aos  serviços de correçoes da lingua feito por pessoas de lingua nativa em inglês seria muito importante

Mais tem outros meios :
Publicar artigo de sintese (review article). Um artigo de sintese não tem nova descoberta mais apresenta uma sintese de um assunto do ponto de vista dos autores. São os artigos mais citados.  Quando eu faço curso em comunicação cientifica para doutores . Explico que a sintese bibliografica feita por tesis pode fazer um bom artigo de sintese para publicar dentro de uma revista.

Também mesmo que a Scielo esteja  bem visivel  com o acesso livre seria bom que as revistas e os autores ampliam a presença das revistas nas redes sociais gerais -Facebook, Twitter- ou mais especifico –Research Gate, Mendeley. Os cientistas precisam ser  formado para usar bem essas ferramentas.

Então a grande força da Scielo e a divulgação dos resultados das pesquisas brasileiras, em acesso livre. Graças a ele, outros pesquisadores tem materiais para se referir (através de citações) e construir novos conhecimentos.

Mendeley para a gestão das referências bibliograficas

A gestão das referências bibliograficas faz parte integrante do processamento de pesquisa e da publicação. Por isso escolhi  de apresentar no meu blog uma ferramenta, Mendeley para a gestão e o compartilhamento das referências bibliograficas. Mendeley em uma ferramenta propriétario mais o uso e gratuito para um número importante de funcionalidades. Ele é só disponível em inglês. O limite mais importante da versão gratuita  é que não é possível compartilhar publicações com grupos de mais de 10 pessoas. As principais funcionalidades são :

1. Busca referências, pessoas ou groupos

É possível adicionar as sua referências próprias além de pesquisar o catálogo de Mendeley  de 30M + papéis,  fazer  importação de outros bancos de dados on-line usando o web importer.

É também possivel achar grupo público, ou pessoas. Mendeley está funcionando como uma rede social.

2. Organizar e pesquisar publicações

Usando o Mendely Desktop, é possível criar uma biblioteca Mendeley para classificar e organizar as publicações.

É possível importar referências a partir de artigos em PDF, de outros ferramentas do mesmo tipo, de banco de dados ou do web sites.

3- Escrever bibliografias dentro de um artigo por exemplo com o formato certo

O Mendeley vai instalar uma barra de ferramentas específica dentro de Open Office o Word para inserir referências com  o formato certo.

4. Leia e recolha idéias

Destaque e anote no Desktop Mendeley PDF Viewer para manter o controle de idéias, pesquisas e experimentos plano de projeto.

5 – Colaboração

Manter contatos com colegas e compartilhar artigos, notas e anotações  com segurança.

Para iniciar é necessário fazer download e instalar o Mendeley. Isso é muito fácil a partir dessa página.

installar mendeley

O guia para inciantes em inglês está aqui :
A figura seguinte mostra o desktop do Mendeley no computador :

desktop do mendeley

O meu objetivo é não fazer um curso sobre Mendeley mais apresentar  alguns posts  nesse blog que vão seguir as possibilidades avançadas dessa ferramenta.

Howopenisit : O SPARC esta tendanto responder na questão “isso e acesso livre ?”

Todos os tipos de Acesso Aberto não  são iguais. Para esclarecer esse assunto e dar HowOpenIsItdefinições dos diferentes tipos  ou responder simplesmente a questão aparamente simples “É Acesso Livre?”,  três associações ou editores PLoS, SPARC e OASPA [1]  têm colaborado para desenvolver um recurso chamado “HowOpenIsIt?” [2].  Este recurso identifica os componentes do núcleo de acesso aberto (OA) e como são implementados em todo o espectro entre “Open Access” e “Acesso Fechado”.

A definição do Acesso livre começou com a Declaração de Berlim sobre Acesso Livre ao Conhecimento nas Ciências e Humanidades [3]

1. O(s) autor(es) e o(s) detentor(es) dos direitos de tais contribuições concede(m) a todos os utilizadores o direito gratuito, irrevogável e mundial de lhes aceder, e uma licença para copiar, usar, distribuir, transmitir e exibir o trabalho publicamente e realizar e distribuir obras derivadas, em qualquer suporte digital para qualquer propósito responsável, sujeito à correcta atribuição da autoria (as regras da comunidade, continuarão a fornecer mecanismos para impor a atribuição e uso responsável dos trabalhos publicados, como acontece no presente), bem como o direito de fazer um pequeno número de cópias impressas para seu uso pessoal.
2. Uma versão completa da obra e todos os materiais suplementares, incluindo uma cópia da licença como acima definida, é depositada (e portanto publicada) num formato electrónico normalizado e apropriado em pelo menos um repositório que utilize normas técnicas adequadas (como as definições Open Archive) que seja mantido por uma instituição académica, sociedade científica, organismo governamental ou outra organização estabelecida que pretenda promover o acesso livre, a distribuição irrestrita, a interoperabilidade e o arquivo a longo prazo.

E possivel fazer comentarios sobre o document howopenisit. As contribuições são abertas ate   8 de outubro. Acesso diretamente no documento em PDF  e em inglês (2 paginas)

Fontes :

Promoção das revistas cientificas em saúde com o Twitter , Facebook e outras redes socias

Um artigo estudou se os jornais em saúde estão usando a technologias do web 2.0 para a promoção deles.

As ferramentas do web 2.O estão mudando o jeito dos pesquisadores ficarem informados sobre a literatura essencial deles. Eles poderem escolher entre visitar os sites das revistas ou de manter informação com o fluxo de informação RSS o com redes socias (Twitter o Facebook…), se o jornal esta divulgando conteúdos na feramenta escolhida. RSS permite aos leitores de accessar a parução de tabela de conteúdo de novos numeros e de novos artigos diretamente, em tempo real, no computador deles. Redes socias tem as vantagens de divulgar a “micro informação” sobre cada artigo e de oferecer as possibilidades de comparthilar ou fazer commentarios sobre eles dentro de sua própria rede de contatos.

248 jornais forma examinados, 42 estão em acesso livre (open access). 29% of jornais tem uma conta Twitter e 25% uma conta Facebook. A maiora tem a função RSS (87%) para permitir aos leitores de seguirem a parução de tabela de conteudo de nova numeros e tb de novos artigos, que são divulgados  primeiro na Internet, e 60 % oferecem no leitor de compartilhar  diretamente a informação na rede social.

Um fato interessante e que os jornais tradicionais estão mais usando (um pouco mais) technologias do web 2.0 que os jornais em accesso livre.
Talvez seja porque as editoras tradicionais colocar mais recursos na promoção de seus jornais. Acha, que seja interessante de comparar as estragias dos jornais no web 2.0 com o rankink – fator de impacto dentro de uma categoria temática, que permite uma classificação dos jornais – do Journal Citation Report.

Fonte : Promoting health sciences journal content with Web 2.0: A snapshot in time
by Sandra L. De Groote. /First Monday/, Volume 17, Number 8 – 6 August 2012
http://www.firstmonday.org/htbin/cgiwrap/bin/ojs/index.php/fm/article/viewArticle/4103/3281

Plos medecine – Twitter

New England Journal of Medecine – Facebook